17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1576 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1576  alternative oxidase  100 
 
 
229 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0387907  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5295  alternative oxidase  87.34 
 
 
229 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.736306  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2564  alternative oxidase  70.19 
 
 
214 aa  293  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.592262  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  64.65 
 
 
209 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1930  putative oxidase  58.29 
 
 
232 aa  258  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.310424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00951  hypothetical protein  53.81 
 
 
211 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  54.5 
 
 
211 aa  234  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  53.3 
 
 
212 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4977  predicted protein  45.37 
 
 
221 aa  186  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_4970  predicted protein  45.37 
 
 
221 aa  186  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  43.46 
 
 
354 aa  181  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  49.15 
 
 
401 aa  179  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  50.92 
 
 
357 aa  165  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  25.95 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5300  predicted protein  26.26 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025079 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3824  alternative oxidase  28.26 
 
 
164 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48063  predicted protein  28.24 
 
 
314 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>