16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5295 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5295  alternative oxidase  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.736306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1576  alternative oxidase  87.34 
 
 		 229 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0387907  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2564  alternative oxidase  66.04 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.592262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  64.32 
 
 		 209 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1930  putative oxidase  58.71 
 
 		 232 aa  251  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.310424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00951  hypothetical protein  58.33 
 
 		 211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  54.5 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  54.31 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  45.79 
 
 		 354 aa  191  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4977  predicted protein  44.39 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_4970  predicted protein  44.39 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  48.59 
 
 		 401 aa  176  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  50.92 
 
 		 357 aa  166  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  26.34 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48063  predicted protein  28.22 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3824  alternative oxidase  26.35 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>