93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0933 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
149 aa  296  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.202646  normal  0.0173337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0036  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  38.89 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35760  hypothetical protein  36.57 
 
 
154 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.28006e-16  decreased coverage  1.5308899999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3064  putative acetyltransferase  36.92 
 
 
131 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1478  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3199  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
222 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4095  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2127  N-acetyltransferase  31.69 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2046  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1218  acetyltransferase  33.58 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065696  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2879  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231437  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2582  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
161 aa  58.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000002184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3837  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
166 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000098197 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1209  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0957  putative acetyltransferase  28.28 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4431  GCN5-related N-acetyltransferase  52.83 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0554  conserved hypothetical protein, putative acetyltransferase (GNAT family)  26.12 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3661  putative acetyltransferase  21.64 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.714516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  26.27 
 
 
312 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1341  GCN5-related N-acetyltransferase  24.62 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  0.0648237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
180 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0331323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  31.3 
 
 
152 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  29.31 
 
 
295 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003393  histone acetyltransferase HPA2  24.11 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
247 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
295 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
225 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.06 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  30.77 
 
 
295 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  30.77 
 
 
295 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2071  acetyltransferase, GNAT family  33.85 
 
 
289 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1443  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
281 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02392  hypothetical protein  24.48 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  35.96 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2515  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
270 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.78 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  41.27 
 
 
289 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2180  acetyltransferase, GNAT family  27.59 
 
 
295 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02479  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02980)  24.56 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0792  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 
294 aa  42  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46600  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
150 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.395219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  32.05 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
173 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6430  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.982998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
152 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.892071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
212 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  32.05 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1640  acetyltransferase  26.76 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  27.59 
 
 
295 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0797  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  20.3 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  27.97 
 
 
267 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2631  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.512633  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2783  putative acetyltransferase  29.49 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3200  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.358197  normal  0.871545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1281  putative acetyltransferase  29.49 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1394  putative acetyltransferase  29.49 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.63 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3524  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193717  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.82 
 
 
195 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.99 
 
 
159 aa  40.4  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2964  acetyltransferase, GNAT family  29.76 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2417  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000513372  hitchhiker  0.0048595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
207 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.29935  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3614  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2003  GCN5-related N-acetyltransferase  25.18 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0801  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  24.1 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1154  histone acetyltransferase  32.05 
 
 
153 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  24.1 
 
 
161 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>