88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1004 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1004  Na+/H+ antiporter subunit  100 
 
 
98 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2737  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  57.3 
 
 
99 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.85542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1393  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  55.06 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2667  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  66.32 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  50.52 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.430346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1034  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  49.4 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0913  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.02 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000172871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  60.71 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1585  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.31 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2166  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.39 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2971  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.3 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01590  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit  63.93 
 
 
95 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.907394  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3663  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhG subunit-like protein  41.79 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.468328  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  66.23 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4625  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.29 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3281  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  47.27 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0266516  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0138  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.7 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1301  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.86 
 
 
95 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.016378  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.05 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2715  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.72 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0886  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318233  normal  0.189914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14800  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.29 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2434  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.65 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.280651 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0576  Na+/H+ antiporter subunit  32.26 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0467  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  25 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3182  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.56 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1353  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.27 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177814  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1918  Na+/H+ antiporter subunit  30.77 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.692305  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1639  Na+/H+ antiporter subunit  37.5 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3813  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.38 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5209  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.11 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000878225  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2283  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0666  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  57.78 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0499  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.21 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0503  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.56 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000166612  hitchhiker  0.000137225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  37.5 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.52 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1278  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.56 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.9 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3142  Na+/H+ antiporter subunit  29.76 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3689  Na+/H+ antiporter subunit  34.52 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0345  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.29 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.919658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0671  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.33 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0035  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  27.63 
 
 
91 aa  47.4  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2338  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.71 
 
 
129 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.755181  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0840  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.43 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  26.32 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0666  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.16 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.94 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  47.37 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35410  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.29 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.273722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3945  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.37 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.188568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2928  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.67 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000165861  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.29 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000161563  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2581  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.81 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0864  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.58 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.74172 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.78 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.894704  normal  0.681404 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0983  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.835749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.76 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  27.84 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0153  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.58 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3537  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  28.92 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0559  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  26.83 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.751126  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0058  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.53 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0895  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.95 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.107177  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0406  sodium/proton antiporter protein  33.33 
 
 
126 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1769  Na(+)/H(+) antiporter subunit G  33.33 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3655  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.53 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0794  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.84 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.95 
 
 
107 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00245075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  41.38 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1107  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.11 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.65 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0566  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40.85 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0384  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  28.57 
 
 
115 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0108812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0492  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.33 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0754  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.86 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0542751  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.35 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2522  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.07 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  43.18 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  48 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1795  Na+/H+ antiporter subunit  31.76 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.257451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.53 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3813  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.26 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.661331  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05200  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.17 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3734  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.14 
 
 
129 aa  40  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0898  Na+/H+ antiporter subunit  29.63 
 
 
132 aa  40  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2861  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  28.74 
 
 
136 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>