85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_01590  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit  100 
 
 
95 aa  177  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.907394  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1004  Na+/H+ antiporter subunit  54.84 
 
 
98 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1393  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  51.11 
 
 
99 aa  87  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2737  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  51.72 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.85542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1034  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  53.57 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  55.56 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.430346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  56.9 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1585  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  43.27 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2667  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  61.9 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14800  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.3 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2166  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.67 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2928  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.87 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000165861  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3182  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.17 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3655  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.11 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3813  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.17 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3663  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhG subunit-like protein  43.66 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.468328  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.12 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1301  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.89 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.016378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3281  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.64 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0266516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0913  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.72 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000172871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2338  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  34.83 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.755181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35410  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.23 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.273722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0138  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.61 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.87 
 
 
110 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000161563  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.67 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0467  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.89 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.71 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0864  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.87 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.74172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1278  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.52 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0886  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.44 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318233  normal  0.189914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0345  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  38.95 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.919658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1918  Na+/H+ antiporter subunit  32.97 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.692305  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2434  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.41 
 
 
135 aa  47  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.280651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.44 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0880  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.26 
 
 
110 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0028264  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1769  Na(+)/H(+) antiporter subunit G  39.08 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2715  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.43 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0406  sodium/proton antiporter protein  39.08 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2861  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.77 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.29 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2522  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.43 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  57.5 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0754  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.77 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0542751  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0734  monovalent cation/proton antiporter  33.33 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850476  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1639  Na+/H+ antiporter subunit  32.95 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0559  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.55 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.751126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.89 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00935817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.14 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.73 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4319  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.55 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.59 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2029  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.71 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.58 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00245075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3734  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3813  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  27.91 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.661331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4625  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.21 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16750  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.37 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0896918  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0035  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  25.58 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0058  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  28.09 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.68 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0983  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.835749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5209  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.64 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000878225  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1353  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  29.55 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177814  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0671  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  36.54 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.736983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0499  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.53 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0577  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0035249  decreased coverage  0.0097103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2283  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
119 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2971  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  28.09 
 
 
124 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3142  Na+/H+ antiporter subunit  30.59 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.26 
 
 
114 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0492  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.95 
 
 
110 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0794  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40.58 
 
 
113 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0895  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.22 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.107177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0666  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.56 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3945  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.33 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.188568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.17 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3720  Na+/H+ antiporter subunit  33.73 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  28.41 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0666  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  44.44 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  30.95 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.894704  normal  0.681404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.82 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0452283  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1795  Na+/H+ antiporter subunit  31.76 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.257451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  39.62 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41192  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3810  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.53 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.266236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3719  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.64 
 
 
110 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>