53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1034 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1034  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  100 
 
 		 107 aa  207  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1393  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  54.12 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2737  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  54.95 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.85542  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1004  Na+/H+ antiporter subunit  49.4 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1585  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.79 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  58.11 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.430346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  52.22 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2166  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0913  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  37.35 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000172871  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1639  Na+/H+ antiporter subunit  33.7 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0467  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.9 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0886  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.04 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318233  normal  0.189914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0499  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2667  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  60.98 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16750  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.67 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0896918  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0503  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  41.18 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000166612  hitchhiker  0.000137225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3655  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.69 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0138  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.95 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  64.71 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2434  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.08 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.280651 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2715  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40.43 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01590  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit  60 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.907394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35410  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  38.37 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.273722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3663  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhG subunit-like protein  34.25 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.468328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0345  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.14 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.919658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0702  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  50 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.814859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1125  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.91 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00876408  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5157  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  45.65 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2971  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.52 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.17 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1105  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.16 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0453301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  35.9 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00245075  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1543  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.82 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0186623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1107  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.62 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0666  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.41 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0384  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  42.59 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0108812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0153  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  30.85 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  44.19 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3852  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  32.97 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3689  Na+/H+ antiporter subunit  32.5 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2928  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  25.26 
 
 		 117 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000165861  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0489  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.79 
 
 		 113 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.894704  normal  0.681404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2868  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.52 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3987  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.87 
 
 		 125 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  31.68 
 
 		 110 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.909982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1446  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  29.63 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0452283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2283  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.56 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2581  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  34.52 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3945  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.31 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.188568 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0100  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  31.76 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2338  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  33.73 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.755181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0794  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.63 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3281  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.29 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0266516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>