23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1585 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1585  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  100 
 
 
108 aa  206  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1004  Na+/H+ antiporter subunit  47.31 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1034  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.79 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1393  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  44.58 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2737  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  45.45 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.85542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  40.82 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.430346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  50.85 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4625  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.76 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2667  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  60 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2166  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  33.33 
 
 
102 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0913  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  36.49 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000172871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  60 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01590  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhG subunit  53.49 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.907394  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0886  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  39.29 
 
 
123 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318233  normal  0.189914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14800  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.18 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2971  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  34.83 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1600  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.73 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2928  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  26.92 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000165861  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0794  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  32.47 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2029  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  40 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0666  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  45.95 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1301  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit G  23.26 
 
 
95 aa  40  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.016378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2715  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  35.29 
 
 
121 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>