80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12154 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12154  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  100 
 
 
93 aa  186  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.904784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3056  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  81.72 
 
 
93 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.902672  normal  0.215782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3471  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  81.72 
 
 
93 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3158  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  79.57 
 
 
93 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.840155  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3208  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  79.57 
 
 
93 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.178335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3146  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  79.57 
 
 
93 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2453  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  74.19 
 
 
93 aa  140  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2149  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  68.82 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2218  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  69.89 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5978  Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase-like protein  68.97 
 
 
87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.863773  normal  0.122016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22180  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  72.41 
 
 
96 aa  126  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17089  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2980  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  72.41 
 
 
87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000428935  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0175  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  66.67 
 
 
87 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5379  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  66.67 
 
 
87 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1862  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  65.52 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.341079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2600  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  64.37 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.138092  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1679  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  63.64 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1674  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  63.22 
 
 
87 aa  114  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.6206e-17 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0294  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.44 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10890  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  60.92 
 
 
87 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16080  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  61.11 
 
 
109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0849521  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18180  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  63.22 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1730  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  59.77 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0342094  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0479  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  59.77 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.134922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2451  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  60.92 
 
 
87 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.938943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1310  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  56.32 
 
 
87 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220774  normal  0.190602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1879  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  60.44 
 
 
100 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159901  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1872  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  61.36 
 
 
100 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2053  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  70.11 
 
 
87 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144495  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1964  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  67.82 
 
 
87 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663376  normal  0.18968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3109  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  55.17 
 
 
87 aa  93.6  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3110  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  54.44 
 
 
109 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2976  phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase  71.67 
 
 
63 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446359  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4317  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  65.52 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.828459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2676  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  41.18 
 
 
205 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.702503  hitchhiker  0.00000310334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0207  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  37.63 
 
 
208 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2745  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  40.74 
 
 
212 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1346  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  44.87 
 
 
206 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1413  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  44.87 
 
 
206 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0826909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2968  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  35.29 
 
 
213 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1007  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  31.52 
 
 
219 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0318  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  32.53 
 
 
242 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1655  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  37.21 
 
 
218 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.826731  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2676  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  39.02 
 
 
216 aa  50.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2349  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  32.97 
 
 
226 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4918  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  34.12 
 
 
216 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1498  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  33.72 
 
 
226 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000910971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4335  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  36.59 
 
 
203 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.210645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2889  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  31.4 
 
 
220 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1621  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  31.76 
 
 
244 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1830  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  28.24 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.53548e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2700  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  34.12 
 
 
210 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2782  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  31.52 
 
 
436 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0389  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  34.67 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09730  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase /phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  38.57 
 
 
244 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000126028  normal  0.0333953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2181  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  28.24 
 
 
217 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.330992  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2740  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  35.37 
 
 
219 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466113  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1995  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  34.94 
 
 
211 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.860681  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1326  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  37.35 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3547  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  35.8 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05611  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  41.03 
 
 
206 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000946732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3403  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  32.26 
 
 
210 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1662  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  28.92 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1135  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  26.74 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1532  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  31.17 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2030  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase / phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  34.72 
 
 
282 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1548  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  31.76 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1901  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  36.36 
 
 
218 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1017  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  33.33 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.664455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1503  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  28.4 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.677068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2548  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  34.18 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5744  phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase  28.4 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1323  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  28.4 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0758  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  29.41 
 
 
237 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08976  histidine biosynthesis bifunctional protein  27.63 
 
 
206 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65137  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2776  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  36.47 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5041  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  40.7 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1198  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  31.25 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000348599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2337  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  31.46 
 
 
197 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0494754  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2163  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  37.21 
 
 
215 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.367981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>