49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0294 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0294  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  100 
 
 		 149 aa  291  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4317  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  75.23 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.828459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5978  Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase-like protein  70.93 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.863773  normal  0.122016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2600  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  68.6 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.138092  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10890  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  69.77 
 
 		 87 aa  120  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2451  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  70.93 
 
 		 87 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.938943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1879  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  66.67 
 
 		 100 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1872  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  66.67 
 
 		 100 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1862  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  68.6 
 
 		 87 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.341079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2453  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  69.77 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3471  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  68.6 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5379  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  67.44 
 
 		 87 aa  116  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1730  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  65.12 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0342094  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3056  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  66.28 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.902672  normal  0.215782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18180  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  65.12 
 
 		 87 aa  114  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1310  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  63.95 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220774  normal  0.190602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12154  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.44 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.904784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3109  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  65.12 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3158  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.44 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.840155  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3208  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.44 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3146  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.44 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0175  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  63.95 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1679  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  58.49 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22180  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  61.63 
 
 		 96 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2149  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  61.63 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0479  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  61.63 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.134922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1674  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  63.95 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.6206e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2218  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  62.79 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16080  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  61.63 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0849521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3110  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  48.21 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2980  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  58.14 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000428935  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1964  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  69.77 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663376  normal  0.18968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2976  phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase  73.33 
 
 		 63 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2053  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  65.12 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144495  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1201  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  35 
 
 		 207 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1007  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  30.11 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1830  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  24.71 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.53548e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1662  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  29.07 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0389  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  35.82 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0318  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  25.19 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2745  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  34.15 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4335  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  37.31 
 
 		 203 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.210645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1195  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  32.5 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1498  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  31.09 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000910971  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3140  predicted protein  30.51 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2889  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  29 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2676  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  32.69 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.702503  hitchhiker  0.00000310334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2349  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  30.23 
 
 		 226 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1621  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  27.16 
 
 		 244 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>