47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4317 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4317  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  100 
 
 		 116 aa  235  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.828459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0294  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  75.23 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2451  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  72.41 
 
 		 87 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.938943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1872  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  71.26 
 
 		 100 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2600  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  68.97 
 
 		 87 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.138092  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5978  Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase-like protein  68.97 
 
 		 87 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.863773  normal  0.122016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3056  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.42 
 
 		 93 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.902672  normal  0.215782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1879  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  68.97 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3471  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  68.18 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5379  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  67.82 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1862  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  66.67 
 
 		 87 aa  116  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.341079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18180  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  66.67 
 
 		 87 aa  116  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1730  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  65.52 
 
 		 87 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0342094  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3158  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.82 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.840155  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3208  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.82 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3109  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  64.37 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3146  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  67.82 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2149  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  63.64 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2453  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  65.52 
 
 		 93 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10890  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  64.37 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12154  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  65.52 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.904784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0175  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  64.37 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0479  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  59.77 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.134922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1310  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  59.77 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.220774  normal  0.190602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22180  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  55.79 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2218  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  61.36 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1674  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  63.22 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.6206e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1679  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  59.14 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16080  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  54.87 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0849521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2980  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  57.47 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000428935  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3110  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  59.3 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1964  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  72.41 
 
 		 87 aa  96.7  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663376  normal  0.18968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2976  phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase  73.33 
 
 		 63 aa  88.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2053  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  65.52 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144495  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2889  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  31.82 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1830  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  26.61 
 
 		 220 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.53548e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2745  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  30.97 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1007  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  32.89 
 
 		 219 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4335  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  38.81 
 
 		 203 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.210645 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1662  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  28.92 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0389  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  34.33 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0318  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  25.23 
 
 		 242 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1201  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  33.33 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1195  bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase protein  33.33 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2181  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  27.06 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.330992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2676  phosphoribosyl-ATP diphosphatase  35.29 
 
 		 205 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.702503  hitchhiker  0.00000310334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0207  phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase  37.31 
 
 		 208 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>