24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1930 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1930  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  486  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2296  hypothetical protein  47.04 
 
 
253 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3366  hypothetical protein  48.41 
 
 
245 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2736  hypothetical protein  48.41 
 
 
245 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2247  hypothetical protein  42.97 
 
 
253 aa  218  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0482  hypothetical protein  43.7 
 
 
244 aa  198  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.076776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4852  hypothetical protein  44.71 
 
 
245 aa  194  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2561  hypothetical protein  48.58 
 
 
233 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1369  hypothetical protein  33.66 
 
 
238 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24848  predicted protein  31.14 
 
 
337 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0885263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15001  hypothetical protein  32.61 
 
 
197 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.698117 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09681  hypothetical protein  28.5 
 
 
215 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0324  hypothetical protein  25.49 
 
 
206 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00776338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08781  hypothetical protein  31.07 
 
 
211 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.190966  hitchhiker  0.000272153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1109  hypothetical protein  35.85 
 
 
238 aa  92  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0914  hypothetical protein  26.87 
 
 
208 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.095439  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09731  hypothetical protein  26.37 
 
 
208 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09751  hypothetical protein  26.37 
 
 
208 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.279382  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44529  predicted protein  33.53 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09971  hypothetical protein  24.86 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.66706  normal  0.370081 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45215  predicted protein  23.1 
 
 
348 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16234  predicted protein  23.6 
 
 
290 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.348437  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29040  predicted protein  27.92 
 
 
319 aa  49.3  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44212  predicted protein  25.95 
 
 
379 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>