14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44529 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44529  predicted protein  100 
 
 
360 aa  738    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2736  hypothetical protein  36.36 
 
 
245 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3366  hypothetical protein  36.36 
 
 
245 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10511  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2247  hypothetical protein  33.16 
 
 
253 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1930  hypothetical protein  33.53 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2296  hypothetical protein  32.1 
 
 
253 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382745 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24848  predicted protein  27.64 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0885263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2561  hypothetical protein  38.55 
 
 
233 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0482  hypothetical protein  34.45 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.076776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4852  hypothetical protein  31.09 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0324  hypothetical protein  21.71 
 
 
206 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00776338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1369  hypothetical protein  26.49 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09751  hypothetical protein  23.7 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.279382  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09731  hypothetical protein  23.53 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>