20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1369 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1369  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1109  hypothetical protein  67.23 
 
 
238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15001  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.698117 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0324  hypothetical protein  39 
 
 
206 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00776338  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09681  hypothetical protein  34.55 
 
 
215 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08781  hypothetical protein  38.89 
 
 
211 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.190966  hitchhiker  0.000272153 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09731  hypothetical protein  30.88 
 
 
208 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09751  hypothetical protein  30.88 
 
 
208 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.279382  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0914  hypothetical protein  31.37 
 
 
208 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.095439  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09971  hypothetical protein  39.33 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.66706  normal  0.370081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1930  hypothetical protein  34.86 
 
 
247 aa  118  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3366  hypothetical protein  36.24 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2736  hypothetical protein  36.24 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2247  hypothetical protein  34.12 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2296  hypothetical protein  34.23 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0482  hypothetical protein  32.2 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.076776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4852  hypothetical protein  32.38 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2561  hypothetical protein  31.88 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24848  predicted protein  29.01 
 
 
337 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0885263 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44529  predicted protein  26.49 
 
 
360 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>