20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1109 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1109  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1369  hypothetical protein  67.23 
 
 
238 aa  318  6e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15001  hypothetical protein  52.78 
 
 
197 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.698117 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0324  hypothetical protein  41.79 
 
 
206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00776338  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09681  hypothetical protein  37.62 
 
 
215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0914  hypothetical protein  36.36 
 
 
208 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.095439  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09731  hypothetical protein  35.89 
 
 
208 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09751  hypothetical protein  35.89 
 
 
208 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.279382  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08781  hypothetical protein  36.32 
 
 
211 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.190966  hitchhiker  0.000272153 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09971  hypothetical protein  38.76 
 
 
180 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.66706  normal  0.370081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1930  hypothetical protein  35.85 
 
 
247 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3366  hypothetical protein  36.77 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2736  hypothetical protein  36.77 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2296  hypothetical protein  36.36 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0482  hypothetical protein  31.56 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.076776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2247  hypothetical protein  31.19 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4852  hypothetical protein  31.95 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2561  hypothetical protein  35.09 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24848  predicted protein  29.44 
 
 
337 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0885263 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44529  predicted protein  26.92 
 
 
360 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>