16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0756 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0756  chain A, D20c mutant of T4 lysozyme  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0925  lysozyme, putative  46.15 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1015  lysozyme  39.37 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0912  phage lysozyme  38.71 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  36.28 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  33.88 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  30.43 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  32.2 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  35.62 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  34.25 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  27.73 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  34.25 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  35.48 
 
 
170 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>