41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1463 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  237  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  87.18 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  80.33 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  80.33 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  82.61 
 
 		 118 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  81.74 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  81.58 
 
 		 118 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  80.7 
 
 		 116 aa  183  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  78.45 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  78.45 
 
 		 118 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  73.17 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  86.32 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  79.51 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  79.51 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  65.57 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  55.74 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  52.07 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  50.41 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  50.41 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  49.17 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  50 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  49.19 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  47.86 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  47.9 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  49.17 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  41.53 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  45.54 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  39.52 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  43.33 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  43.33 
 
 		 118 aa  87  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  43.33 
 
 		 118 aa  87  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  44.17 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  44.17 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  42.5 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  41.67 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  35.38 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  36.15 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>