41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1969 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  100 
 
 		 125 aa  256  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  56.56 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  57.38 
 
 		 123 aa  140  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  54.4 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  54.4 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  57.72 
 
 		 122 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  57.39 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  54.17 
 
 		 124 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  58.41 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  58.41 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  52.94 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  58.41 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  55.37 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  53.33 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  55.46 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  51.64 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  52.54 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  53.33 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  51.67 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  55.74 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  56.56 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 144 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  50.4 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  53.78 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  47.93 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  55.37 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  52.99 
 
 		 137 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  55.75 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  55.75 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  46.15 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  41.67 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  40.83 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  39.67 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  38.33 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  40 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  36.97 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  36.97 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  36.97 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  36.04 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  34.38 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>