41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0708 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  89.15 
 
 		 129 aa  229  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  86.09 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  82.2 
 
 		 123 aa  190  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  85.22 
 
 		 118 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  84.35 
 
 		 118 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  84.21 
 
 		 116 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  81.2 
 
 		 122 aa  186  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  78.45 
 
 		 118 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  78.45 
 
 		 118 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  86.32 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  74.58 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  76.42 
 
 		 123 aa  167  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  77.97 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  69.23 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  55.37 
 
 		 125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  56.36 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  53.91 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  52.59 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  52.59 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  53.64 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  53.64 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  51.35 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  44.19 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  47.27 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  42.24 
 
 		 145 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  47.75 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  45.38 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  45.38 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  44.63 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  44.63 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  43.7 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  39.13 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  38.46 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>