41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1805 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  255  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  89.15 
 
 		 129 aa  210  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  86.96 
 
 		 118 aa  193  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  78.86 
 
 		 123 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  86.09 
 
 		 118 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  85.22 
 
 		 118 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  82.05 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  83.33 
 
 		 116 aa  186  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  87.18 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  77.59 
 
 		 118 aa  180  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  77.59 
 
 		 118 aa  180  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  70.73 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  76.42 
 
 		 123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  76.86 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  70.83 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  55.37 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  51.69 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  51.69 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  53.04 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  54.55 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  54.55 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  51.82 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  50.91 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  50.91 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  50.44 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  48.18 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  43.55 
 
 		 145 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  46.85 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  46.15 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  44.54 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  44.54 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  47.06 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  45.38 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  44.54 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  45.38 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  40 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  39.32 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>