41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0573 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  99.15 
 
 		 118 aa  230  5e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  97.46 
 
 		 118 aa  227  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  94.83 
 
 		 116 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  92.11 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  91.23 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  83.48 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  85.22 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  82.05 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  82.05 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  84.35 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  87.83 
 
 		 123 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  78.95 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  81.58 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  71.3 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  58.41 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  57.66 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  56.76 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  55.86 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  55.86 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  53.15 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  52.25 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  53.15 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  49.55 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  49.55 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  48.65 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  45.3 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  46.43 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  42.37 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  42.02 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  42.5 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  42.5 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  40.16 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  42.02 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  42.86 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  41.59 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>