21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0576 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0576  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1788  hypothetical protein  66.08 
 
 
172 aa  228  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.190801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  52.3 
 
 
176 aa  193  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0963  protein of unknown function DUF177  41.22 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.132362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4712  hypothetical protein  35.33 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0945852  normal  0.92586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3437  hypothetical protein  39.31 
 
 
169 aa  104  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0371  protein of unknown function DUF177  36.55 
 
 
167 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223895  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0364  protein of unknown function DUF177  36.55 
 
 
167 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5263  protein of unknown function DUF177  36.42 
 
 
167 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23091  normal  0.0658863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0689  hypothetical protein  36.55 
 
 
168 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1619  metal-binding protein  40.25 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.056507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  25.6 
 
 
161 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3814  protein of unknown function DUF177  20.78 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234061  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  29.25 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3693  protein of unknown function DUF177  29.03 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  26.8 
 
 
185 aa  44.3  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  24.02 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1174  hypothetical protein  26.74 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  26.63 
 
 
179 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  28.86 
 
 
193 aa  41.2  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  29.11 
 
 
187 aa  41.2  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000297886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>