23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1619 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1619  metal-binding protein  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.056507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0963  protein of unknown function DUF177  49.69 
 
 		 167 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.132362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4712  hypothetical protein  40.72 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0945852  normal  0.92586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5263  protein of unknown function DUF177  49.38 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23091  normal  0.0658863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0371  protein of unknown function DUF177  42.77 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0364  protein of unknown function DUF177  42.77 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0689  hypothetical protein  41.67 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3437  hypothetical protein  42.51 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  42.58 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1788  hypothetical protein  44.16 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.190801  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0576  hypothetical protein  40.12 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  26.06 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000297886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  28.24 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  28.99 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0723626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2503  hypothetical protein  27.06 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  27.93 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  26.74 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  24.1 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1274  hypothetical protein  24.81 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000334048  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08880  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  27.17 
 
 		 190 aa  42  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.486062  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1566  protein of unknown function DUF177  29.06 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0425556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2782  hypothetical protein  29.66 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.161111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1942  protein of unknown function DUF177  27.74 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000072056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>