15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0984 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0984  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  869    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.136767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1416  hypothetical protein  46.49 
 
 
442 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1509  hypothetical protein  45.91 
 
 
442 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2837  hypothetical protein  45.68 
 
 
442 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130589  normal  0.483673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1700  hypothetical protein  46.56 
 
 
443 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2646  hypothetical protein  46.21 
 
 
442 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.458074  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1518  hypothetical protein  45.68 
 
 
442 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1545  hypothetical protein  45.68 
 
 
442 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2579  hypothetical protein  45.75 
 
 
442 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2754  hypothetical protein  46.1 
 
 
442 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3564  hypothetical protein  43.65 
 
 
428 aa  342  8e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.408858  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0655  hypothetical protein  39.11 
 
 
418 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0040  hypothetical protein  26.59 
 
 
400 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13813  hitchhiker  0.00125865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1018  hypothetical protein  22.15 
 
 
392 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0985  hypothetical protein  22.15 
 
 
392 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>