15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0655 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0655  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  837    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1416  hypothetical protein  41.59 
 
 
442 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1545  hypothetical protein  41.67 
 
 
442 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1509  hypothetical protein  41.22 
 
 
442 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1700  hypothetical protein  41.19 
 
 
443 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2837  hypothetical protein  41.22 
 
 
442 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0130589  normal  0.483673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1518  hypothetical protein  41.44 
 
 
442 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2754  hypothetical protein  41.14 
 
 
442 aa  292  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2646  hypothetical protein  40.23 
 
 
442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.458074  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2579  hypothetical protein  40 
 
 
442 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0984  hypothetical protein  39.11 
 
 
429 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.136767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3564  hypothetical protein  39.14 
 
 
428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.408858  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0040  hypothetical protein  29.3 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13813  hitchhiker  0.00125865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1018  hypothetical protein  22.73 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0985  hypothetical protein  22.73 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>