15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0174 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0194  hypothetical protein  68.33 
 
 		 61 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0254  hypothetical protein  64.41 
 
 		 59 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4315  hypothetical protein  70.69 
 
 		 58 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4116  hypothetical protein  77.78 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0121  hypothetical protein  72.41 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4242  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3487  hypothetical protein  70 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4184  hypothetical protein  68.09 
 
 		 47 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4610  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3043  hypothetical protein  41.43 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00029722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04009  hypothetical protein  51.79 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1042  hypothetical protein  58 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001449  hypothetical protein  51.79 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06267  hypothetical protein  57.14 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>