16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4315 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4315  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0254  hypothetical protein  70.69 
 
 
59 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0194  hypothetical protein  62.07 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4116  hypothetical protein  94 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4184  hypothetical protein  97.87 
 
 
47 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0121  hypothetical protein  72.41 
 
 
58 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0174  hypothetical protein  70 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4242  hypothetical protein  46.3 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4610  hypothetical protein  79.63 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3487  hypothetical protein  74 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3795  hypothetical protein  79.17 
 
 
48 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04009  hypothetical protein  50 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3868  hypothetical protein  77.08 
 
 
48 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06267  hypothetical protein  58.18 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001449  hypothetical protein  53.57 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  45.9 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>