17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3487 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3487  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0254  hypothetical protein  66.1 
 
 		 59 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0194  hypothetical protein  55 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4315  hypothetical protein  75.86 
 
 		 58 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0121  hypothetical protein  70.69 
 
 		 58 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4116  hypothetical protein  78.57 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0174  hypothetical protein  67.35 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4242  hypothetical protein  42.59 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4184  hypothetical protein  70.21 
 
 		 47 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1042  hypothetical protein  68 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04009  hypothetical protein  51.79 
 
 		 56 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4610  hypothetical protein  71.83 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06267  hypothetical protein  56.36 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001449  hypothetical protein  53.57 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  42.03 
 
 		 77 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  42.03 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0315  hypothetical protein  35.94 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>