17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0254 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0254  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0194  hypothetical protein  57.63 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4315  hypothetical protein  70.69 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0121  hypothetical protein  70.69 
 
 		 58 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4242  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4116  hypothetical protein  72 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0174  hypothetical protein  62 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4184  hypothetical protein  68.09 
 
 		 47 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3487  hypothetical protein  66 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  49.15 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06267  hypothetical protein  50.91 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  47.46 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4610  hypothetical protein  61.11 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04009  hypothetical protein  42.86 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0883  putative transmembrane protein  45.76 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001449  hypothetical protein  44.64 
 
 		 78 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  40.98 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>