19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4116 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4116  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4315  hypothetical protein  93.1 
 
 
58 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0194  hypothetical protein  66.67 
 
 
61 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0254  hypothetical protein  71.19 
 
 
59 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4184  hypothetical protein  91.49 
 
 
47 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0121  hypothetical protein  74.14 
 
 
58 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0174  hypothetical protein  77.78 
 
 
72 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4610  hypothetical protein  80.26 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3487  hypothetical protein  78.57 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4242  hypothetical protein  48.15 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3795  hypothetical protein  81.25 
 
 
48 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04009  hypothetical protein  53.57 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3868  hypothetical protein  79.17 
 
 
48 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06267  hypothetical protein  56.36 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3043  hypothetical protein  35.71 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00029722  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001449  hypothetical protein  54.39 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  42.25 
 
 
77 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  43.48 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0297  hypothetical protein  46.27 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.851712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>