27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1979 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1979    100 
 
 
369 bp  731    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1156    96.43 
 
 
302 bp  365  6e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.262972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0448    93.9 
 
 
483 bp  238  9e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0332  hypothetical protein  92.4 
 
 
279 bp  236  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0379    95.8 
 
 
156 bp  228  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0439    96.9 
 
 
258 bp  224  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000012003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0689    93.75 
 
 
390 bp  222  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1042    96.9 
 
 
222 bp  216  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0586    96.24 
 
 
368 bp  216  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0560    93.96 
 
 
228 bp  216  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0370    96.92 
 
 
210 bp  210  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0242    95.24 
 
 
210 bp  202  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2359    88.36 
 
 
333 bp  200  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0451    93.57 
 
 
208 bp  198  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0837    87.98 
 
 
375 bp  198  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2414  hypothetical protein  93.57 
 
 
282 bp  198  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0581855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0297    91.27 
 
 
210 bp  163  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0893    91.27 
 
 
210 bp  163  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000358556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0686    98.57 
 
 
284 bp  131  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0256    89.83 
 
 
274 bp  131  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2125    97.14 
 
 
239 bp  123  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0071    96.97 
 
 
238 bp  115  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0253    95.31 
 
 
123 bp  103  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  93.65 
 
 
1332 bp  93.7  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1037    88.16 
 
 
162 bp  79.8  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0889  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  94 
 
 
1230 bp  67.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000293372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1905  hypothetical protein  95.12 
 
 
690 bp  65.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>