26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0370 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



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Replicon accession

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0370    100 
 
 
210 bp  416  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0439    95.63 
 
 
258 bp  321  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000012003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1156    96.39 
 
 
302 bp  315  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.262972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1042    94.31 
 
 
222 bp  309  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0242    91.94 
 
 
210 bp  268  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0297    91.13 
 
 
210 bp  236  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0893    92.74 
 
 
210 bp  228  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000358556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0686    96.83 
 
 
284 bp  218  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0586    97.48 
 
 
368 bp  212  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0689    98.25 
 
 
390 bp  210  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1979    96.92 
 
 
369 bp  210  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0332  hypothetical protein  90 
 
 
279 bp  202  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2125    96.94 
 
 
239 bp  170  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0451    100 
 
 
208 bp  127  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0448    95.89 
 
 
483 bp  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0071    92.59 
 
 
238 bp  105  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0253    95.59 
 
 
123 bp  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2359    94.37 
 
 
333 bp  101  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2414  hypothetical protein  94.2 
 
 
282 bp  97.6  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0581855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0256    95.08 
 
 
274 bp  97.6  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  95 
 
 
1332 bp  95.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0837    96.3 
 
 
375 bp  91.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0379    97.87 
 
 
156 bp  85.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1037    89.04 
 
 
162 bp  81.8  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0889  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  94.74 
 
 
1230 bp  81.8  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000293372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0560    91.18 
 
 
228 bp  79.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
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