28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0586 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0586    100 
 
 
368 bp  729    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0689    93.9 
 
 
390 bp  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0686    95.47 
 
 
284 bp  387  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0837    91.27 
 
 
375 bp  317  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2125    92.89 
 
 
239 bp  311  6.999999999999999e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0448    92.24 
 
 
483 bp  291  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0560    92.49 
 
 
228 bp  280  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1156    96.1 
 
 
302 bp  258  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.262972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2359    94.41 
 
 
333 bp  252  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0439    96.18 
 
 
258 bp  220  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000012003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1979    96.24 
 
 
369 bp  216  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0370    97.48 
 
 
210 bp  212  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0451    94.2 
 
 
208 bp  210  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2414  hypothetical protein  91.07 
 
 
282 bp  206  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0581855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1042    94.7 
 
 
222 bp  206  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0332  hypothetical protein  92.59 
 
 
279 bp  188  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0256    89.71 
 
 
274 bp  188  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0297    93.65 
 
 
210 bp  178  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0253    94.26 
 
 
123 bp  178  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0242    93.28 
 
 
210 bp  172  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0379    92.31 
 
 
156 bp  170  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0071    90.24 
 
 
238 bp  149  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0893    89.23 
 
 
210 bp  139  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000358556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  95 
 
 
1332 bp  95.6  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0889  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  94.64 
 
 
1230 bp  79.8  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000293372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1037    88.57 
 
 
162 bp  75.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1905  hypothetical protein  95.12 
 
 
690 bp  65.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1336  hypothetical protein  91.67 
 
 
552 bp  48.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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