26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0439 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



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Replicon accession

Locus tag

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0439    100 
 
 
258 bp  511  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000012003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1156    98.45 
 
 
302 bp  351  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.262972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1042    95.71 
 
 
222 bp  337  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0370    95.63 
 
 
210 bp  321  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0242    94.15 
 
 
210 bp  311  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0297    92.72 
 
 
210 bp  274  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0332  hypothetical protein  92.12 
 
 
279 bp  260  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0893    90.15 
 
 
210 bp  236  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000358556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0686    96.38 
 
 
284 bp  234  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1979    96.9 
 
 
369 bp  224  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0586    96.18 
 
 
368 bp  220  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0689    99.09 
 
 
390 bp  210  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2125    96.94 
 
 
239 bp  170  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2414  hypothetical protein  95.89 
 
 
282 bp  121  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0581855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0451    98.44 
 
 
208 bp  119  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0071    95.45 
 
 
238 bp  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0448    93.59 
 
 
483 bp  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2359    95.45 
 
 
333 bp  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0837    98.15 
 
 
375 bp  99.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0560    91.78 
 
 
228 bp  97.6  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0253    93.75 
 
 
123 bp  95.6  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0379    97.92 
 
 
156 bp  87.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  93.33 
 
 
1332 bp  87.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0889  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  94.55 
 
 
1230 bp  77.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000293372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1037    87.67 
 
 
162 bp  73.8  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0256    97.56 
 
 
274 bp  73.8  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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