28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1156 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1156    100 
 
 
302 bp  599  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.262972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1979    96.43 
 
 
369 bp  365  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0332  hypothetical protein  93.02 
 
 
279 bp  353  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0439    98.45 
 
 
258 bp  351  7e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000012003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1042    97.41 
 
 
222 bp  343  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0370    96.39 
 
 
210 bp  315  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0448    97.09 
 
 
483 bp  301  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0242    95.26 
 
 
210 bp  297  9e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0560    95.32 
 
 
228 bp  276  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0689    96.88 
 
 
390 bp  270  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0297    93.43 
 
 
210 bp  266  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0451    97.3 
 
 
208 bp  262  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0586    96.1 
 
 
368 bp  258  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0379    95.39 
 
 
156 bp  230  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0686    99.14 
 
 
284 bp  222  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0893    91.57 
 
 
210 bp  218  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000358556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0837    93.48 
 
 
375 bp  202  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2414  hypothetical protein  92.25 
 
 
282 bp  194  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0581855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2125    96.94 
 
 
239 bp  170  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0256    89.66 
 
 
274 bp  127  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0071    96.97 
 
 
238 bp  115  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2359    98.28 
 
 
333 bp  107  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0253    95.31 
 
 
123 bp  103  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  96.3 
 
 
1332 bp  91.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0889  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  94.74 
 
 
1230 bp  81.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000293372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1037    89.55 
 
 
162 bp  77.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1085  phosphopantetheinyl transferase-like protein  97.3 
 
 
708 bp  65.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1905  hypothetical protein  95.12 
 
 
690 bp  65.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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