16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5365 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5365  Type IV conjugative transfer system protein TraL  100 
 
 		 101 aa  201  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4012  TraL family protein  66.67 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2156  hypothetical protein  63.83 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1541  TraL family protein  38.24 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  0.243552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2314  hypothetical protein  38 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2647  hypothetical protein  38 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4540  type IV conjugative transfer system protein TraL  34.44 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.370941  normal  0.572808 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4443  type IV conjugative transfer system protein TraL  34.44 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4373  type IV conjugative transfer system protein TraL  34.44 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4497  type IV conjugative transfer system protein TraL  34.44 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4447  Type IV conjugative transfer system protein TraL  32.22 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0038  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  32.53 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.889559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4632  type IV conjugative transfer system protein TraL  33.33 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.765356 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0074  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  27.47 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4284  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  29.03 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0015  hypothetical protein  31.71 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>