14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_4012 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_4012  TraL family protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234696  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5365  Type IV conjugative transfer system protein TraL  66.67 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2156  hypothetical protein  65.59 
 
 		 95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0038  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  31.65 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.889559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2314  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2647  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1541  TraL family protein  32.26 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  0.243552 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4447  Type IV conjugative transfer system protein TraL  32.22 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4540  type IV conjugative transfer system protein TraL  32.22 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.370941  normal  0.572808 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4497  type IV conjugative transfer system protein TraL  32.22 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4443  type IV conjugative transfer system protein TraL  32.22 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4632  type IV conjugative transfer system protein TraL  31.11 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.765356 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4373  type IV conjugative transfer system protein TraL  31.11 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0074  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  26.09 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>