13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0038 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0038  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  100 
 
 		 103 aa  213  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.889559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0074  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  47.57 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4284  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  44.55 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4497  type IV conjugative transfer system protein TraL  27.27 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4540  type IV conjugative transfer system protein TraL  27.27 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.370941  normal  0.572808 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4443  type IV conjugative transfer system protein TraL  27.27 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4632  type IV conjugative transfer system protein TraL  26.26 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.765356 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4447  Type IV conjugative transfer system protein TraL  26.26 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4373  type IV conjugative transfer system protein TraL  26.26 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4012  TraL family protein  31.65 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234696  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5365  Type IV conjugative transfer system protein TraL  32.53 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2156  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_03  conjugative transfer protein TraL  25 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>