13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4443 on replicon NC_011668
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4443  type IV conjugative transfer system protein TraL  100 
 
 		 100 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4540  type IV conjugative transfer system protein TraL  99 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.370941  normal  0.572808 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4497  type IV conjugative transfer system protein TraL  99 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4373  type IV conjugative transfer system protein TraL  98 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4632  type IV conjugative transfer system protein TraL  98 
 
 		 100 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.765356 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4447  Type IV conjugative transfer system protein TraL  97 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_03  conjugative transfer protein TraL  41.41 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0038  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  27.27 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.889559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5365  Type IV conjugative transfer system protein TraL  34.44 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4012  TraL family protein  32.22 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234696  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0015  hypothetical protein  28.41 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2156  hypothetical protein  32.22 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0074  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  24.49 
 
 		 101 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>