13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0074 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0074  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  100 
 
 		 101 aa  206  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0038  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  47.57 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.889559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4284  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  48.48 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5365  Type IV conjugative transfer system protein TraL  27.47 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0023  hypothetical protein  27.78 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2156  hypothetical protein  26.37 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4447  Type IV conjugative transfer system protein TraL  25.51 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_03  conjugative transfer protein TraL  27.17 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4540  type IV conjugative transfer system protein TraL  24.49 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.370941  normal  0.572808 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4443  type IV conjugative transfer system protein TraL  24.49 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4012  TraL family protein  26.09 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234696  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4373  type IV conjugative transfer system protein TraL  23.47 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4497  type IV conjugative transfer system protein TraL  24.49 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>