35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2370 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2370  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2167  hypothetical protein  47.45 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.013575  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1798  hypothetical protein  27.17 
 
 		 316 aa  85.9  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.69 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2027  hypothetical protein  24.73 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.594988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1019  hypothetical protein  27.34 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0241  hypothetical protein  24.18 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.13 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.37 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0280  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.23 
 
 		 552 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.86 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0595  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.880292  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1340  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.12 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1073  major antigenic peptide PEB4  26.49 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.364345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0253  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  27.93 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0699  major antigenic peptide PEB4  26.49 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0114  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  30.53 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0738  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.613681 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0624  major antigenic peptide PEB4  26.49 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.796304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.32 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000154337 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0514  foldase protein PrsA  23.7 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2047  hypothetical protein  29.69 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0262  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein  37.1 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0517  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.35 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.317125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0584  hypothetical protein  30.1 
 
 		 129 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  37.21 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2523  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.9 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  37.21 
 
 		 429 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.42 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000367752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0216  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.27 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000196807  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0389  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.26 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271785  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3255  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.03 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.12 
 
 		 310 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2020  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.46 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0486856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0112  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.36 
 
 		 344 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000942479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>