21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2368 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0738  hypothetical protein  42.14 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.613681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1798  hypothetical protein  39.93 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0241  hypothetical protein  39.18 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2027  hypothetical protein  33.1 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.594988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2167  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.013575  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2370  hypothetical protein  28.14 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1019  hypothetical protein  24.29 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0114  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  29.23 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.6 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  28.28 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2114  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.64 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000109897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.53 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.19 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000154337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1362  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.5 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5213  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.35 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.18959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.969048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1221  foldase protein PrsA  25 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1900  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.64 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2906  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.22 
 
 		 263 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.175953  normal  0.376466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>