21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1798 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1798  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0241  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.3 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0738  hypothetical protein  38.27 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.613681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2027  hypothetical protein  34.08 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.594988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2370  hypothetical protein  28.2 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1019  hypothetical protein  26.22 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0114  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  23.95 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2167  hypothetical protein  25.65 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.013575  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  30.66 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.61 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.18 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000154337 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2069  holo-[acyl-carrier-protein] synthase  25.65 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.56973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.37 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.12 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.84 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000367752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2931  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.63 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2047  hypothetical protein  25.93 
 
 		 289 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1094  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.33 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2020  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.1 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0486856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>