16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2047 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2047  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.26 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.54 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04811  signal peptide protein  24.54 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.170909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.45 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.71 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000032571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3181  putative signal peptide protein  25.09 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.2743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3054  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.57 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0251204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1798  hypothetical protein  25.93 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  20.43 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0241  hypothetical protein  31.47 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2598  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.44 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5054  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.73 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3331  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.51 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2027  hypothetical protein  27.15 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.594988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1196  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.05 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>