36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2027 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2027  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.594988  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1798  hypothetical protein  34.8 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64046  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0241  hypothetical protein  34.77 
 
 
330 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.51 
 
 
299 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0738  hypothetical protein  28.84 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.613681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1019  hypothetical protein  29.02 
 
 
269 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2167  hypothetical protein  23.72 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.013575  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2370  hypothetical protein  23.72 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.39 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  28.32 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.61 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000469336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.12 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000154337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.55 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000961276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0923  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.5 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.04 
 
 
324 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000367752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2020  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.19 
 
 
270 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0486856  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1752  foldase protein PrsA  25.87 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0114  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  25.77 
 
 
272 aa  50.1  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5445  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.96 
 
 
245 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.14 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000032571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0624  major antigenic peptide PEB4  27.52 
 
 
273 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.796304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0699  major antigenic peptide PEB4  28.33 
 
 
273 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1073  major antigenic peptide PEB4  28.33 
 
 
273 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.364345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.39 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2047  hypothetical protein  27.15 
 
 
289 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3100  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.78 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1340  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.1 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1868  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.6 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.232086 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0914  major antigenic peptide PEB-cell binding factor  26.62 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.617147  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0517  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.81 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.317125  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1287  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.14 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0253  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  24.65 
 
 
248 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4334  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.4 
 
 
317 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4694  putative PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.64 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135101  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_003296  RS04811  signal peptide protein  37.8 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.170909  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein  24.58 
 
 
325 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.812435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>