40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2292 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2292  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 197 aa  410  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442753  hitchhiker  0.00612299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2284  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  98.45 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2300  hypothetical protein  41.01 
 
 		 194 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1001  putative ring-cleavage dioxygenase  30.95 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4060  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 		 160 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.8 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0821  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.64 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24 
 
 		 159 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.14 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.013526 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6490  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.52 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6725  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.52 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  26.23 
 
 		 159 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1037  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.74 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.23 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.08 
 
 		 326 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1559  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0635  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.88 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.354638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.26 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  26.56 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4358  glyoxalase family protein  35.94 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3514  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.22 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  26.83 
 
 		 324 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.26 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2243  catechol 2,3-dioxygenase  29.92 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.824084 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.38 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.9 
 
 		 306 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.33 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.216826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.22 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0836593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0726  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.05 
 
 		 374 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.35 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>