18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0085 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0085    100 
 
 		 312 bp  618  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.67061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  80.39 
 
 		 363 bp  131  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  81.99 
 
 		 444 bp  101  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  81.52 
 
 		 480 bp  93.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  81.52 
 
 		 477 bp  93.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  89.04 
 
 		 438 bp  81.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  80.57 
 
 		 483 bp  77.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  89.23 
 
 		 369 bp  73.8  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  83.33 
 
 		 420 bp  63.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  91.3 
 
 		 486 bp  60  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  94.74 
 
 		 441 bp  60  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  89.36 
 
 		 381 bp  54  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  93.94 
 
 		 459 bp  50.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  83.33 
 
 		 462 bp  48.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1049  phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase  93.55 
 
 		 414 bp  46.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2028  carbamoyl phosphate synthase large subunit  96.3 
 
 		 3255 bp  46.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  89.74 
 
 		 405 bp  46.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  89.74 
 
 		 405 bp  46.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>