18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36990  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0292206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3869  hypothetical protein  42.28 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0835  hypothetical protein  43.92 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0249958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3102  hypothetical protein  37.64 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0780  hypothetical protein  42.66 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5524  hypothetical protein  41.22 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5749  hypothetical protein  38.98 
 
 		 322 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5143  hypothetical protein  40.46 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5232  hypothetical protein  40.46 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2713  hypothetical protein  38.41 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0516  hypothetical protein  35.8 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00149183  hitchhiker  0.00000250398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0874  hypothetical protein  38.89 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0132843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1074  hypothetical protein  38.32 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5024  hypothetical protein  36.18 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3395  hypothetical protein  41.94 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1552  hypothetical protein  34 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0687  hypothetical protein  36.21 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>