19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0835 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0835  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  567  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0249958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0780  hypothetical protein  83.33 
 
 
309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36990  hypothetical protein  40.33 
 
 
248 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0292206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3869  hypothetical protein  39.79 
 
 
318 aa  92.8  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5524  hypothetical protein  39.13 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5143  hypothetical protein  37.89 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5232  hypothetical protein  37.89 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157078  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0516  hypothetical protein  46.72 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00149183  hitchhiker  0.00000250398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1552  hypothetical protein  37.66 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2713  hypothetical protein  41.45 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5749  hypothetical protein  35.19 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3102  hypothetical protein  37.58 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5024  hypothetical protein  30.2 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0838  hypothetical protein  38.51 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1074  hypothetical protein  36.24 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3395  hypothetical protein  39.49 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0687  hypothetical protein  38.46 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0874  hypothetical protein  37.93 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0132843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4281  hypothetical protein  44.44 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>