18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5024 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5024  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5524  hypothetical protein  41.75 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5143  hypothetical protein  41.03 
 
 
278 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5232  hypothetical protein  41.03 
 
 
278 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5749  hypothetical protein  41.57 
 
 
322 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2713  hypothetical protein  40.12 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0780  hypothetical protein  34.71 
 
 
309 aa  99  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3869  hypothetical protein  39.39 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0835  hypothetical protein  31.54 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0249958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1074  hypothetical protein  40.45 
 
 
254 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0516  hypothetical protein  42.31 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00149183  hitchhiker  0.00000250398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36990  hypothetical protein  36.18 
 
 
248 aa  79  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0292206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1552  hypothetical protein  31.61 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0838  hypothetical protein  33.73 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3102  hypothetical protein  32.86 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0874  hypothetical protein  31.68 
 
 
344 aa  52.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0132843  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3395  hypothetical protein  31.41 
 
 
304 aa  52.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0687  hypothetical protein  40.45 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>