19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3102 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3102  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3869  hypothetical protein  42.59 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0838  hypothetical protein  41.92 
 
 
340 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0516  hypothetical protein  40.33 
 
 
373 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00149183  hitchhiker  0.00000250398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0687  hypothetical protein  43.02 
 
 
314 aa  99  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3395  hypothetical protein  45.25 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36990  hypothetical protein  37.64 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0292206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2713  hypothetical protein  32.61 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0780  hypothetical protein  34.39 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0835  hypothetical protein  37.58 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0249958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1552  hypothetical protein  33.77 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0874  hypothetical protein  36.89 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0132843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5232  hypothetical protein  34.64 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157078  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5143  hypothetical protein  34.64 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1074  hypothetical protein  32.04 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5524  hypothetical protein  34.43 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5749  hypothetical protein  32.73 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5024  hypothetical protein  31.73 
 
 
305 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4281  hypothetical protein  34.92 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>